就像医用的益生菌药物和风靡人类保健品市场的各种益生菌一样，发挥各种功效的饲用益生菌（添加剂）已得到禽畜养殖业和水产养殖业的一致认同，并得到了广泛使用。
饲用益生菌的主要功效同样也是调节胃肠道微生态平衡，增强机体的非特异性免疫功能，减少病害发生，促进消化吸收及饲料利用率，提高生长速度等。
主要的饲用益生菌有植物乳杆菌、嗜酸乳杆菌、干酪乳杆菌、双歧杆菌、粪肠球菌、地衣芽孢杆菌、酵母等，另外还有以乳酸菌为主的青贮饲料添加剂，将新鲜的饲草料中的淀粉和可溶性糖，经乳酸菌发酵成乳酸，抑制其他杂菌的繁殖，不仅能使饲料长期保存，而且能够使饲草料保险，具有更好的适口性和更高的营养价值。
因此，益生菌在养殖过程中的合理使用，可大大降低抗生素的使用量，为养殖病害防治提供一个全新的解决途径，并可提高养殖产品质量，创造更高的经济效益。
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